Atas kesungguhan hati para pengurus dan pengajar dalam upaya meningkatkan penyelenggaraan sekolah dan peran serta instansi terkait baik pusat maupun daerah pada tahun 1961 melalui Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor : 68772/B.II tanggal 20 Desember 1961, STM Berbantuan ditingkatkan statusnya menjadi STM Bersubsidi.

Pada tahun ajaran 1963/1964 STM Bersubsidi menambah jurusan baru yaitu Jurusan Listrik, kemudian pada tahun ajaran 1964/1965 membuka Jurusan Bangunan Air, sehingga seluruh jurusan yang dimiliki oleh STM Bersubsidi pada waktu itu menjadi 4 jurusan yaitu Jurusan Mesin, Jurusan Listrik, Jurusan Bangunan Gedung dan Jurusan Bangunan Air. Untuk menunjang penyelenggaraan pendidikan sekolah yang berkualitas Yayasan sebagai penyelenggara lembaga pendidikan harus menyediakan fasilitas yang cukup diantaranya adalah ketersediaan ruang belajar yang representatif, karena semenjak berdiri kegiatan sekolah menggunakan fasilitas ST Negeri yang berlokasi di Jalan Gatot Subroto Purwokerto. Alhasil pada tahun 1965 Yayasan Pendidikan Teknik (YPT) dapat mengusahakan tanah seluas 1,5 ha yang berlokasi di Desa Rejasari tepatnya di Jalan Raya Kalibogor Purwokerto. Lokasi ini rencananya digunakan sebagai kegiatan belajar mengajar STM Bersubsidi. Untuk mewujudkan rencana tersebut segera Yayasan sebagai pemilik lahan menajalin kerjasama dengan CV. HARUMAN Bandung sebagai pelaksana pembangunan gedung sekolah melalui kontrak yang diketahui oleh instansi resmi/pemerintah membentuk Panita Pembangunan Gedung STM dan Perumahan Guru STM dan panitia tersebut ditetapkan melalui Surat Keputusan Bupati Kabupaten Banyumas Nomor : 22/2/I/KDH tanggal 15 Maret 1966. Walaupun Surat Keputusan Bupati Kabupaten Banyumas ditetapkan pada tahun 1966, namun Panitia Pembangunan Gedung STM sudah melaksanakan kegiatannya sejak tanggal 17 Desember 1965 agar supaya pada waktu yang ditentukan bisa segera ditempati.

Dengan adanya jaminan dan kepastian ketersediaan gedung sebagai kegiatan belajar mengajar, Pengurus Yayasan melalui surat Nomor : 002/JPT/1967 tanggal 27 Februari 1967 disusuli dengan surat desakan Nomor : 035/JPT/1968 tanggal 20 Februari 1968 mengajukan permohonan kepada Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia untuk menegerikan STM Bersubsidi. Sambil menunggu Surat Keputusan dari Direktorat Jenderal Pendidikan Dasar dan Menengah, Katorda Ditjen Pendidikan Dasar Jawa Tengah dengan Surat Keputusan Nomor : 402/II/1968 tanggal 26 Februari 1968 menegerikan STM Bersubdisi untuk Jurusan Bangunan Gedung dan Bangunan Air terhitung sejak tanggal 01 Januari 1968 untuk Jurusan Mesin dan Listrik masih berstatus STM Bersubsidi. Dengan perubahan 2 jurusan tersebut maka masing-masing STM dipimpin oleh Kepala Sekolah sendiri-sendiri.

Pada tahun ajaran 1969/1970 dengan sepengetahuan Bupati Kabupaten Banyumas STM Bersubsidi dan STM Negeri Purwokerto pindah lokasi ke Desa Rejasari tepatnya Jalan Raya Kalibogor Purwokerto untuk menempati bangunan gedung yang telah selesai dibangun oleh Panitia Pembangunan STM, yaitu 7 ruang teori, 1 ruang gambar, 1 ruang guru, 2 ruang Kepala Sekolah, 2 ruang kantor/TU dan sebagai pelengkap bangunan sekolah yaitu 1 kamar mandi/wc. Kemudian secara bertahap pada tahun 1975 Yayasan meneruskan pembangunan kelas-kelas berikutnya yang dananya bersumber dari orang tua murid.

Dalam upaya Yayasan menegerikan dua jurusan yang masih tertinggal (Jurusan Mesin dan Listrik), mulai tahun ajaran 1976/1977 STM Negeri Purwokerto membuka jurusan baru yaitu Jurusan Mesin dan Jurusan Listrik, dengan demikian harapan Yayasan untuk menegerikan dua jurusan tersebut semakin sulit. Pada tahun 1976 STM Negeri berpindah lokasi ke Jalan Gatot Subroto Purwokerto menempati bekas ST Negeri Purwokerto yang terkena likuidasi dan berubah menjadi SMP Negeri 7 yang berlokasi di Desa Teluk Purwokerto akibat Kebijakan Pemerintah Mengenai Penyederhanaan Sistem Pendidikan Teknik Tingkat Pertama (STP). Untuk STM Bersubsidi tetap menempati lokasi di Jalan Raya Kalibogor di Desa Rejasari Purwokerto (Jalan Laksda Yos Sudarso No. 3 Purwokerto sebagai lokasi SMK Wiworotomo di Purwokerto saat ini).

Yayasan sebagai Penyelenggara STM Bersubsidi bersama-sama dengan pimpinan lembaga membuka jurusan baru yaitu Jurusan Bangunan Gedung dan Jurusan Bangunan Air sebagai pengganti 2 jurusan yang sebelumnya dinegerikan, pada tahun ajaran 1976/1977, selain itu pertimbangan lain pembukaan jurusan baru ini adalah untuk menampung lulusan ST-SMP yang semakin banyak berkeinginan melanjutkan sekolah di STM Bersubsidi. Sesuai petunjuk Dirjen Pendidikan Dasar Menengah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia di Jakarta pada tahun ajaran 1977/1978, sekolah diberi indentitas/pengenal “WIWOROTOMO” dengan Surat Keputusan Nomor : 55100/D.77 tertanggal 04 Oktober 1977 nama STM Bersubsidi berubah menjadi STM Wiworotomo Bersubsidi (lebih dikenal dengan sebutan STM Wiber). Pemberian identitas/pengenal “Wiworotomo” mempunyai makna sebagai berikut : WIWORO berarti JALAN sedangkan TOMO berarti UTAMA kalau diartikan menjadi “STM Wiworotomo sebagai tujuan/jalan menuju kearah keutamaan bagi semua anak didiknya khususnya dan seluruh Keluarga Besar Wiworotomo umumnya”, harus disadari bahwa nama Wiworotomo merupakan pandangan hidup atau prinsip dasar lembaga dalam mencapai tujuan, sehingga perlu dijaga dan dipertahankan kelestariannya oleh seluruh “Keluarga Besar Wiworotomo” sampai kapanpun.

Berdasarkan Surat Edaran Sekjen Depdikbud Nomor : 41007/A;AS/01/1997 tanggal 03 April 1997, sebagai tindak lanjut dari Kepmen Depdikbud Nomor : 034, 035 dan 036/O/1997 perihal Perubahan Nomenklator, maka pada tahun ajaran 1997/1998 STM Wiworotomo Bersubsidi berubah nama menjadi SMK Wiworotomo hingga saat ini.